Phpnuke używa kompresji wyjścia nie sprawdzając czy jest ona włączone w globalnej konfiguracji serwera. Na serwerach kompresja jest włączona automatycznie. Aby strona była wyświetla prawidłowo należy w pliku: "mainfile.php"
Strona default, czyli wyświetlana gdy domena kieruje na serwer, a nie jest przypisana do żadnego katalogu znajduje się w katalogu public_html na koncie default (konto default jest dostępne w panelu WebAs w taki sam sposób jak każde inne konto FTP). Można tam wstawić dowolny kod obsługiwany przez Apache, czyli php/html/cgi i inne.