Na wszystkich kontach e-mail obsługiwanych na serwerach Kei.pl zainstalowane jest komercyjne oprogramowanie skanera antywirusowego. Działanie skanera polega na wykrywaniu wirusów i odrzucaniu wiadomości, w których wirus zostanie wykryty.
Baza wirusów skanera uaktualniana jest nawet kilka razy w ciągu dnia, w związku z czym daje on 98% skuteczności. Skaner jest automatycznie włączony dla każdego istniejącego konta.